До текущих ролей Марат Толибаєв был основателем и директором Activat с 2013 по 2019 год в Астане. Также он занимал должность заместителя министра сельского хозяйства Республики Казахстан с 2011 по 2013 год, где управлял привлечением инвестиций в сельское хозяйство, переработкой сельскохозяйственной продукции и контролировал торговую и социальную политику в сельских районах. 

Ранее в своей карьере Марат Толибаєв был председателем Совета SEC "Тобол" с 2007 по 2010 год, сосредоточив внимание на региональном привлечении инвестиций и финансировании бизнеса. Он также работал заместителем акима города Астана с 2004 по 2007 год, занимаясь земельными, транспортными вопросами, государственными закупками и культурными делами.

Его работа в Activat VC сосредоточена на инвестициях в инновационные идеи, которые улучшают и упрощают жизнь. Кроме того, с 2013 года он возглавляет "Smart Investments", ориентируясь на менторство и инвестиции в различных секторах.